本发明涉及电池加工领域,尤其涉及一种超声式微孔结构燃料电池质子交换膜加工设备。为了解决质子交换膜表面的微孔结构的底部的膜层被向上拉起,以及微孔结构中藏纳有大量的杂质,均会影响质子交换膜吸纳性能的技术问题。本发明提供了这样一种超声式微孔结构燃料电池质子交换膜加工设备,包括有微孔调整单元和振动除杂单元等;振动除杂单元的左侧连接微孔调整单元。本发明提供的技术方案中,将质子交换膜的中部拉伸,由刷毛借助弯曲的回弹力,配合超声波对质子交换膜的微孔结构进行调整,随后由弹片对质子交换膜进行振动处理,并在超声振动的配合下,质子交换膜微孔结构内藏纳的杂质被振除,保障质子交换膜的离子溶液吸纳性能。