周运

发布时间:2024-04-18浏览次数:10


周运,男,19783月生,九三学社社员,副教授,博士,硕士生导师。

个人简历

1997.9-2001.6 信阳师范学院应用电子技术专业,本科

2002.9-2005.6 西南石油大学计算机应用专业,硕士

2012.9-2016.6 3499cc拉斯维加斯生物信息学专业,博士

电子邮箱: zy@htu.edu.cn

研究方向

生物信息学,主要从事面向生物医学数据的深度学习预测模型研究。

主持的科研项目

1. 2024.1-2025.12, 基于深度学习框架的药物-靶标预测和药物功能重定位模型研究, 河南省科技攻关项目(242102210001) 主持,在研

2. 2020.1-2023.12,面向复杂数据的粒计算模型与应用研究,国家自然科学基金面上项目(61976082) 第三参与人,已结项

3. 2021-2022,新冠病毒复杂传播网络模型构建及传播社区发现方法研究,河南省科技攻关项目(212102310381) 主持,已结项

4. 2018-2019,时间序列基因表达谱数据的网络系统生物学方法研究,河南省自然科学基金项目(182300410306) 主持,已结项

5. 2016-2017,时间序列基因表达谱的聚类方法研究河南省教育厅高等学校重点科研项目(17A520039) 主持,已结项

6. 2012-2014,提炼和筛选肝再生关键基因的方法研究,河南省基础与前沿计划技术研究项目(122300410355) 主持,已结项

发表论文

[1] Wei Wang*, Bin Sun, MengXue Yu, ShiYu Wu, Dong Liu, Hongjun Zhang, Yun Zhou*.GraphPLBR: Protein-Ligand Binding Residue Prediction With Deep Graph Convolution Network[J].IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023,20(3): 2223 - 2232

[2] Wei Wang*, MengXue Yu, Bin Sun, Juntao Li, Dong Liu, Hongjun Zhang, XianFang Wang, Yun Zhou*.SMGCN: Multiple Similarity and Multiple Kernel Fusion based Graph Convolutional Neural Network for Drug-Target Interactions Prediction[J].IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023,14(11):1-12

[3] Wei Wang*, Xili Su, Dong Liu, Hongjun Zhang, Xianfang Wang, Yun Zhou*. Predicting DNA-binding protein and coronavirus protein flexibility using protein dihedral angle and sequence feature[J].Proteins-Structure Function and Bioinformatics,2022,11:1-11

[4]Wei Wang*, Yu Zhang, Dong Liu*, HongJun Zhang, XianFang Wang,Yun Zhou*. Prediction of DNA-Binding Protein-Drug-Binding Sites Using Residue Interaction Networks and Sequence  Feature[J].Front. Bioeng. Biotechnol. 2022,10:82239

[5]Wei Wang*, Yu Zhang, Dong Liu, HongJun Zhang, XianFang Wang, Yun Zhou*. PseAraUbi: predicting arabidopsis ubiquitination sites by incorporating the physicochemical and structural features[J].Plant Molecular Biolog, 2022,110(1-2):81-92

[6]Wei Wang*Shihao LiangMengxue YuDong LiuHongJun ZhangXianFang WangYun Zhou*.GCHN-DTI: Predicting drug-target interactions by graph convolution on heterogeneous networks[J].Methods, 2022,206:101-107


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